Действие этого анимационного фильма развивается в 2015 году, после масштабной катастрофы, произошедшей пятнадцать лет назад. Эта катастрофа, получившая название Второй Удар, была вызвана резким климатическим изменением и вызвала глобальное потепление. Для сравнения, Первый Удар, по легендам и теориям внутри сюжета, стал причиной вымирания динозавров. В результате Второго Удара ледяные покровы Антарктиды растаяли, что привело к затоплению значительной части суши и гибели примерно трёх четвертей населения Земли.
Со временем экосистема земли начала восстанавливаться, а человеческая цивилизация пыталась вернуть свою стабильность. В ответ на угрозы нового мира, под эгидой Организации Объединённых Наций была создана секретная военная структура «NERV». Главной её базой стала Токио-3 — опорный пункт для обороны человечества от загадочных и гигантских существ, известных как Ангелы или Посланники. Эти существа обладают мощной энергетикой и способностью наносить разрушения, несоизмеримые с обычным оружием.
В качестве главного средства борьбы против Ангелов были разработаны биологические роботы — «Евангелионы» — объединяющие в себе технологии и живые организмы. Однако управление этими гигантскими машинами оказалось возможным лишь для подростков, родившихся после Второго Удара, обладающих особой психологической и биологической подготовкой. Среди них центральное место занимает Икари Синдзи — сын главы организации NERV, который становится первым пилотом боевого «Евангелиона». Ему приходится справляться не только с внешними угрозами, но и с внутренними переживаниями, связанными с напряжёнными отношениями с отцом и собственными психологическими трудностями.
Несмотря на то, что участники проекта и окружающие их люди сосредоточены на защите человечества, за кулисами скрывается гораздо более мрачная истина. Реальная цель проекта «Евангелион» связана с подготовкой к неизбежному Концу Света — глобальному событию, которое может кардинально изменить судьбу всего живого на планете.
Дополнительно стоит отметить, что фильм затрагивает темы философии, психологии и социальной изоляции, а также исследует сложные взаимоотношения между человеком и технологиями. Использование биороботов в качестве оружия поднимает вопросы этики и ответственности, а мистические аспекты истории Ангелов добавляют глубину и многослойность повествованию.
