Это полнометражное аниме представляет собой альтернативную версию известного сериала «Макросс». В центре сюжета находится Земля, разрушенная инопланетными захватчиками – расой Зентради, состоящей исключительно из огромных воинов-мужчин. Спасаясь от гибели, около пятидесяти тысяч человек покидают родную планету на колоссальном звездном корабле под названием Макросс. Этот корабль принадлежит другой таинственной расе – Мельтранди, состоящей исключительно из женщин, которые ведут непримиримую войну с Зентради. Теперь выжившие стремятся покинуть Солнечную систему, чтобы избежать преследования жестоких врагов.
Хотя конфликт с инопланетянами служит фоном, в центре повествования оказывается сложный любовный треугольник. Главный герой, Хикару Ичидзе, талантливый пилот боевого истребителя «Валькирия», одновременно испытывает чувства к своей боевой напарнице Мисе Хаясе и молодой певице Лин Мэй, чей нежный и волшебный голос особенно притягивает его внимание. Их переплетённые эмоции показывают, что даже на фоне вселенских войн человеческие чувства остаются живыми и важными.
Однажды во время штурма корабля Хикару спасает Лин Мэй, ценой серьезных повреждений своего истребителя. Позже вместе с Мисой он оказывается на загадочной планете, где им предстоит раскрыть секреты древней цивилизации – Протокультуры, чьи технологии и знания могут изменить ход всей войны. Тайны этой культуры связаны с происхождением обеих враждующих рас и хранят ключ к возможному миру в галактике.
Согласно древним легендам Зентради, те, кто вступит в противостояние с микронианцами – крошечными землянами, обречены на поражение и смерть. Тем не менее, люди, объединённые мужеством и технологическим превосходством, имеют шанс положить конец многолетней войне. Это аниме исследует не только масштабные сражения и межзвёздные драмы, но и вопросы надежды, человечности и возможности сосуществования разных рас в огромной вселенной.
