Действия происходят в марте 0093 года, в период, известный как Вселенский век. В это время разгорается новый виток конфликта между силами Зиона и Федерацией Земли. Главный герой — Чар Азнабль — пять лет скрывался в бегах, оставаясь вне поля зрения и не давая о себе знать. Однако, после долгого затишья, он решает вернуться, чтобы вновь возглавить борьбу Зиона против Федерации Земли.
Чар Азнабль — один из самых харизматичных и умелых командиров в истории конфликта. Только он способен привести Зион к победе. По его приказу Зион сбрасывает на штаб Федерации, расположенный в Тибете, астероид под названием «Пятая Луна». В ответ Федерация планирует применить против Зиона аналогичный план, намереваясь сбросить на Землю свой астероид — «Аксис».
Для борьбы с угрозой Федерации был сформирован элитный отряд под названием «ЛондоБелл», в который вошли лучшие ветераны Однолетней войны — Амуро Рей и Брайт Ноа. Чар Азнабль, движимый жаждой мести, стремится наказать Рея, которого считает виновником гибели Лалы Сун. Вокруг астероида «Аксис» разворачиваются ожесточённые сражения, где отряд «ЛондоБелл» делает все возможное, чтобы предотвратить падение астероида на Землю и сорвать планы Чара.
Данный конфликт входит в череду событий, которые повлияют на дальнейшую судьбу Вселенского века. Помимо масштабных военных действий, в истории затрагиваются темы личной ответственности, дружбы и предательства. Сложные взаимоотношения между персонажами и напряжённая борьба между двумя сторонами делают этот период одним из самых драматичных и значимых в летописи космической истории.