Огненный метеорит стремительно мчится к Земле, прорезая атмосферу с колоссальной скоростью. При входе в озоновый слой он едва не задевает Рейквазу — могущественного хранителя неба, обитающего в этой загадочной области атмосферы. Метеорит разбивается в полярной зоне, раскрывая таинственные кристаллы, напоминающие яйца. Чтобы разобраться с таинственным гостем, Рейкваза спускается на поверхность Земли и сталкивается с инопланетным пришельцем по имени Деоксис, которого считает угрозой для мира.
В жестокой битве, сопровождаемой разрушениями и хаосом, Рейкваза проявляет всю свою силу, нанося удар и раня мальчика Тори, который случайно оказался в эпицентре событий. Схватка достигает апогея, и, казалось бы, Деоксис повержен — его тело развалилось, оставляя после себя лишь зеленый кристалл, упавший в ледяное море. Однако, вопреки ожиданиям, Деоксис смог выжить, путешествуя в скрытности и восстанавливая свои силы на протяжении нескольких лет.
Прошло четыре года с тех пор, как Эш Кетчум вместе с друзьями Май, Максом и Броком прибыли в высокотехнологичный город Ларусе, расположенный в регионе Хённе. Там они встречают Тори — изменившегося мальчика, ставшего замкнутым и напуганным из-за пережитой трагедии и своих встреч с покемонами. Между тем, Деоксис полностью восстановил свою мощь и отправился на поиски зеленого кристалла, являющегося ключом к его силе и связанного с исследованиями, которые родители Тори ведут в своей лаборатории.
Стоит отметить, что Рейкваза является одним из Легендарных покемонов драконьего и летающего типа, символизируя гармонию и баланс атмосферы Земли. Деоксис же — покемон, прибывший из космоса, известный своими изменчивыми формами и способностью адаптироваться к любым условиям боя. Сюжет их противостояния не только подчеркивает столкновение природной мощи и инопланетной технологии, но и затрагивает темы ответственности, доверия и преодоления страхов, раскрывая глубокие взаимоотношения между людьми и покемонами.
