Действие разворачивается в далеком будущем, где жизнь людей кардинально изменилась под влиянием технологий и генетических экспериментов. Некогда могущественная корпорация «Син Ра» контролировала мир, создавая генетически модифицированных воинов, наделённых выдающейся силой и выносливостью. Эти бойцы выполняли сложнейшие задания и служили орудием корпорации в покорении планет и подавлении сопротивления. Одним из самых опасных был воин по имени Сефирот, который усиливался, поглощая энергию своих жертв, что делало его практически неуязвимым и увеличивало боевой потенциал после каждого сражения.
Однако группа повстанцев под руководством харизматичного Клауда Страйфа смогла объединить силы и сокрушить тиранию «Син Ра», освободив планету от гнёта и тирании. После победы Клауд стремился оставить свои боевые дела в прошлом и найти покой, но судьба приготовила для него новые испытания. На горизонте появилась загадочная эпидемия, быстро распространяющаяся и уносящая жизни без возможности лечения. Болезнь вызывала стремительное ухудшение состояния, приводя к массовым смертям и угрозе полного исчезновения человечества.
Осознавая масштаб надвигающейся катастрофы, Клауд берет на себя миссию раскрыть истину, стоящую за вспышкой трагедии. По мере расследования он сталкивается с тайным заговором, который связан с остатками корпорации «Син Ра» и ее экспериментами над генетическим материалом. Вопреки опасностям и внутренним демонам, Клауд с новым отрядом союзников готовится к последней битве за будущее человечества.
