Кей Кусанаги — обычный старшеклассник, живущий привычной для подростка жизнью, наполненной учебой и повседневными заботами. Однажды, поздним вечером, прогуливаясь у озера и погружаясь в свои мысли, он неожиданно замечает гигантскую водяную воронку, возникшую из ниоткуда. Такое зрелище поражает его воображение — до этого момента Кей никогда не видел ничего подобного. Это событие становится отправной точкой для необычной истории, которая только начинает разворачиваться.
Вскоре после появления воронки происходит загадочная телепортация, и на берегу возникает высокая женщина в черном костюме, необычайно эффектная и загадочная. Кей испытывает сильный эмоциональный шок и сразу же теряет сознание, падая в воду. К счастью, ему на помощь приходит Мидзухо Кадзами — новая преподавательница, недавно пришедшая работать в его школу. Ее своевременное вмешательство спасает жизнь юноше.
Со временем Мидзухо назначают куратором класса, в котором учится Кей. В школе она быстро становится предметом обсуждения среди учеников благодаря своей привлекательной и мистической внешности. В начале Кей считает, что та странная встреча с таинственной женщиной была лишь сном или иллюзией, но вскоре он убедится, что это была суровая реальность. Женщина в черном — это и есть сама Мидзухо, чья настоящая сущность скрывает множество тайн и связана с инопланетным происхождением.
Со временем Кей начинает узнавать больше о мире, в который он случайно оказался вовлечен. Инопланетянка Мидзухо обладает необычными способностями, которые она использует для защиты Земли от неизвестных угроз. С каждым днем жизнь Кей приобретает всё более захватывающий и опасный оборот, и теперь от него самого зависит, как он сможет справиться с новыми вызовами и сохранить своих близких в безопасности.