Действие анимационного фильма разворачивается в недалёком будущем, в 2032 году. Технологии сделали огромный шаг вперёд: человечество теперь сосуществует с киборгами и продвинутыми роботами, которые интегрированы в повседневную жизнь общества.
Главный герой, детектив Бато, представляет собой живого киборга — его тело частично искусственное: вместо конечностей используются механические протезы, в то время как мозг остался человеческим и хранит воспоминания о прошлом, включая отношения с Мотоко Кусанаги, важной фигурой в его жизни. В полиции Бато специализируется на борьбе с террористическими угрозами и сложными преступлениями, используя свои кибернетические способности для раскрытия дел.
Совместно с напарником Тосугой он берётся за расследование таинственной серии убийств, жертвами которых становятся люди, убитые собственными роботами. Все устройства относятся к экспериментальной линии секс-андроидов, недавно выпущенных компанией Locus Solus, которая занимает лидирующие позиции в робототехнике и промышленном производстве андроидов.
Компания, осознавая масштаб угрозы репутации, пытается решить проблему путём отзывов неисправных моделей и прикрытия инцидентов, предлагая компенсации семьям погибших. Однако детективы Бато и Тосуга непоколебимы — они не поддадутся давлению, угрозам или коррупции. Их цель — довести расследование до конца, выявить настоящих виновных и обеспечить справедливость, демонстрируя сложные взаимоотношения между человеком и машиной в цифровую эпоху.
Фильм постепенно раскрывает этические и философские вопросы, связанные с развитием искусственного интеллекта, правами киборгов и границами человечности, что делает сюжет особенно актуальным в контексте стремительного технологического прогресса нашего времени.