Пятнадцатилетний Цукунэ Аоно столкнулся с непростой ситуацией: он не смог сдать вступительные экзамены в старшую школу, в которую поступили его друзья. Это могло означать потерю целого года, но судьба приготовила ему неожиданную возможность. Отец Цукунэ получил загадочное приглашение для сына в уникальное учебное заведение — Призрачную Академию. В отличие от обычных школ, эта академия принимает учеников независимо от их академических достижений, и здесь учатся не люди, а сверхъестественные существа.
Родители Цукунэ были рады такому внезапному повороту событий и без колебаний отправили сына в путь. Однако за первым впечатлением скрывалась необычная реальность. Поездка привела Цукунэ в совершенно иной мир: небо было окрашено в жуткий красный оттенок, на территории отсутствовала сотовая связь, а по воздуху порхали говорящие мыши, что напоминало сцены из произведений Говарда Лавкрафта. Это место оказалось границей между обычным миром и миром мистики.
Вскоре страхи Цукунэ сменились удивлением, когда с неба на него буквально обрушилась таинственная и очаровательная девушка по имени Мока. Она раскрыла ему правду: Призрачная Академия — это школа для нечисти, где обучают контролировать свои сверхъестественные способности и жить среди людей, не выдавая своей истинной сущности. В академии учатся вампиры, оборотни, привидения и многие другие создания из легенд и мифов. Интригующим остаётся вопрос — как Цукунэ, будучи смертным, смог пройти через мощный защитный барьер, который убивает любого обычного человека при попытке пересечения?
Оказалось, что в судьбе Цукунэ скрыта необычайная тайна — он сам имеет частичку демонической крови, что и позволило ему не пострадать в процессе поступления. В академии ему предстоит освоить свои силы и понять, кем он на самом деле является. Его необычные способности и дружба с Мокой станут ключом к разгадке тайн этого загадочного мира и борьбе с темными силами, угрожающими как Академии, так и обычному миру.
