В центре сюжета мультфильма находится семья Симпсонов, продолжающая вести привычную жизнь в небольшом городе Спрингфилде. В это время местные власти сообщают о серьезном загрязнении Спрингфилдского озера и вводят запрет на сброс отходов в него, чтобы предотвратить дальнейшее ухудшение экологии. Однако только Мардж и Лиза внимательно относятся к этим предупреждениям и пытаются донести важность проблемы до окружающих.
Однажды Гомер, собравшись избавиться от баков с отходами, долгое время стоявшими во дворе семьи, вместо того чтобы отвезти их на утилизацию, решает проехать мимо, поскольку спешит на распродажу пончиков. В результате он выбрасывает один из баков прямо в озеро. Этот поступок становится катастрофической ошибкой: уровень загрязнения воды стремительно растет, и из-за токсичности начинают происходить мутации, о чем свидетельствует трансформация обитателя озера — бурундука.
Вскоре власти принимают радикальное решение — установить над городом огромный прозрачный купол, чтобы изолировать зону экологического бедствия и предотвратить распространение загрязнений на соседние регионы. Несмотря на оправданность таких мер, жители Спрингфилда выражают протесты, ведь купол отрезает их от внешнего мира и нарушает привычный образ жизни. Когда находят бак с отходами, выясняется, что виновником загрязнения стал Гомер, что приводит к его и семьи изгнанию из общественного круга.
После этого Симпсоны берутся за миссию по спасению города: им предстоит разработать план по очищению озера и разрушению купола. В процессе они узнают больше о негативных последствиях загрязнения окружающей среды и необходимости бережного отношения к природе. Этот сюжет подчеркивает важность экологической ответственности и коллективных усилий в борьбе с загрязнением.