В центре истории оказались добросердечные сантехники Марио и его младший брат Луиджи, которые всегда готовы прийти на помощь друзьям и ответственно относятся к своей работе. Однажды, выполняя ремонтные работы в системе водоснабжения Нью-Йорка, они случайно обнаружили секретный путь в загадочное Грибное королевство — волшебное место, скрытое от посторонних глаз.
Это королевство управляется жестоким и коварным Боузером, злобным королём, который удерживает в плену настоящую наследницу престола, принцессу Пич. К тому же, под властью Боузера население Грибного королевства страдает от страха и гнета. Марио и Луиджи решают бросить вызов тирании, найти в себе силы и смелость, чтобы освободить принцессу и вернуть мир и справедливость в этот волшебный мир.
Перед братьями открывается череда удивительных приключений: им предстоит сразиться с разнообразными врагами, преодолеть опасные ловушки и загадочные испытания. В процессе пути важную роль сыграет не только их братская поддержка, но и крепкая дружба с жителями королевства, таких как Тодд и другие спасённые союзники. Также один из братьев найдет свою истинную любовь — принцессу Пич, чьи чувства помогут укрепить их решимость. Кроме того, с помощью новых друзей героям удастся не только свергнуть Боузера, но и найти способ вернуться в родной Бруклин, сохранив чувства и память о проделанном подвиге.
