После столетий после 20-го века природа и экосистемы оказались практически уничтожены из-за масштабного применения ядерного и биологического оружия. Земля превратилась в безжизненную пустошь: огромные территории были загрязнены радиоактивными и токсичными отходами, большинство живых организмов вымерло, а биоразнообразие сократилось до критически низких уровней.
Современный мир стоит на пороге шестого массового вымирания — «Большой шестерки», которое грозит стереть остатки флоры и фауны с лица планеты. В стремлении сохранить исчезающие виды человечество построило уникальные летающие города в атмосфере — искусственные арки жизни, где животные и растения получили шанс на выживание. За десятилетия, проведённые в изоляции, многие животные эволюционировали: с помощью генной инженерии им был дарован разговорный язык, способность ходить на двух ногах и развивать сложную культуру, что приблизило их к человеческому образу жизни. В новых городах они создали собственные общества и цивилизации, свободные от прежних земных нужд и запретов.
Тем временем жизнь на поверхности земли забывалась и становилась лишь легендой. Однако однажды в одном из небесных городов было найдено семя необычного растения, важного для восстановления экологии. Трое детей — Куи, Хирум и Рут — нашли это семя и, ведомые любопытством и желанием понять истинный мир, решились на опасное путешествие вниз, на разрушенную, опустошённую планету. Они и не подозревали, что спустившись на землю, они навсегда изменят свою судьбу и судьбу всех обитателей летающих городов.
Что же ждёт их на земле? Как изменятся взгляды и жизнь тех, кто осмелится покинуть безопасные небесные города? И смогут ли они найти способ вернуть планете былое величие или же столкнутся с новыми опасностями, от которых нет спасения?