Действие разворачивается в альтернативной вселенной, где после окончания Второй мировой войны человечество сталкивается с внезапной инопланетной угрозой. Пришельцы атакуют Землю, вынуждая разобщённые силы разных стран сплотиться ради выживания и сопротивления захватчикам.
Главная угроза исходит от существа, называемого Мозг, которое высаживается в населённом пункте и выделяет смертельно опасные ядовитые газы. Вокруг него действуют Призрачные звери — специальные инопланетные бойцы, предназначенные для захвата территорий и защиты Мозга от контратак. Даже применение ядерного оружия не приносит долгосрочного успеха — враги отступают лишь временно, оставаясь серьёзной опасностью для человечества.
В ответ на вызов корпорация Сибамура разрабатывает инновационное оружие — вакуумную бомбу РВЕ, способную разрушать жизненно важные структуры Мозга. Этот прорыв несколько изменил ход войны в пользу людей, но затяжные оборонительные операции серьёзно исчерпали людские ресурсы армий разных стран.
В Японии была проведена масштабная реформа призыва: возраст бойцов снижен до шестнадцати лет, что позволило мобилизовать молодых школьников. Обучение и боевые действия проходили одновременно — курсанты с разным уровнем подготовки распределялись в командные подразделения, становились пилотами боевых механоидов HWT или обслуживающим персоналом. Каждый класс представлял собой отдельное боевое звено, тесно взаимодействующее с другими.
Кроме того, развитие технологий привело к созданию специальных симуляторов и тренажёров, позволяющих молодым бойцам быстрее адаптироваться к сложным условиям боя и управлению HWT. В ходе конфликта человеческое общество не только боролось с внешним врагом, но и сталкивалось с внутренними противоречиями, усилением напряжённости между поколениями и постепенной трансформацией социальной структуры, обусловленной вовлечением подростков в военную службу.
