Организация «Хеллсинг» на протяжении десятилетий выполняет миссию по защите Великобритании от тёмных сил и сверхъестественных угроз. Её возглавляет могущественный и харизматичный лидер по имени Интегра Фэйрбрук Вингейтс Хеллсинг — представительница древнего рода, обладающая не только властью, но и решимостью остановить тьму. Под её руководством действует высококвалифицированный отряд бойцов, специально обученных сражаться с нечистью. Особое место в команде занимает Уолтер — пожилой, но невероятно сильный и верный дворецкий, способный своей меткостью и силой нейтрализовать несколько упырей одновременно. Главным инструментом организации в борьбе с демоническими существами является Алукард — древний, бессмертный и чрезвычайно могущественный вампир, обладающий нечеловеческой силой. Он сражается с монстрами и защищает человеческий мир от полного поглощения тьмой.
В одном из отдалённых английских селений начали загадочно исчезать местные жители. Специальное подразделение «Хеллсинга» вместе с начинающим бойцом и молодой девушкой Викторией Серас отправилось расследовать эти события. Однако на месте их ожидала смертельная ловушка: большинство солдат были уничтожены, включая командира отряда. Виктория, несмотря на официальную смерть, была спасена Алукардом, который, используя свою силу, превратил её в вампира. Теперь она стоит на стороне «Хеллсинга», обучаясь контролировать свои новые способности и участвуя в сражениях против монстров, одновременно борясь с внутренними конфликтами, вызванными своей природой.
Тем временем в стране распространяется опасный и зловещий мор — погибают не только жертвы вампирских укусов, но и те, кто подвергается другому виду превращения. Выясняется, что к этим событиям причастна могущественная и жестокая организация — Королевские Протестантские Рыцари (или Институт Янтарного Креста). Они видят в «Хеллсинг» врага и стремятся установить собственный контроль над сверхъестественными силами. Конфликт между двумя сторонами обостряется, превращаясь в настоящую войну, в которой на кону стоит судьба человечества и тьма, жаждущая поглотить мир.