Сюжет аниме «Загадочная девушка Х» рассказывает о необычной школьнице по имени Микото Урабэ и ее однокласснике Цубаки Акире. Микото выделяется своим загадочным поведением и своеобразным характером, из-за чего она часто отпугивает окружающих, особенно мальчиков. Несмотря на это, она привлекательна и миловидна, что привлекает внимание некоторых парней, хоть сама девушка и держится отстраненно. В общении с одноклассниками Микото крайне сдержанна и редко говорит, что делает ее загадочной фигурой среди сверстников.
Ее странность заключается в том, что она обладает даром видеть невидимые обычным людям сверхъестественные существа — духов и монстров. Для борьбы с этими существами Микото использует необычное оружие — обычные ножницы, которые для нее превращаются в мощный инструмент защиты. Этот аспект ее жизни остается главным секретом, и немногие кроме нее знают о постоянных опасностях, с которыми она сталкивается. Сюжет показывает, как Микото совмещает обычную школьную жизнь и роль защитницы от темных сил.
Когда Микото появляется в их классе, одноклассник Цубаки Акира сразу обращает на нее внимание. Вопреки осторожности сверстников, Акира проявляет не только интерес, но и смелость, чтобы подойти ближе к загадочной девушке. Между ними быстро устанавливается особая связь, необычайная и мистическая — полуфизическая, полуэмоциональная, которая передается через слюну. Эта связь позволяет молодым людям общаться без слов и выражать свои чувства, находясь на расстоянии друг от друга. Более того, они способны видеть общие сны, что делает их отношения уникальными и глубоко эмоциональными. Благодаря этому феномену они понимают, что начинают влюбляться и не могут жить друг без друга.
Интересно, что в произведении поднимаются темы одиночества, принятия собственной уникальности и борьбы с внутренними страхами. Микото, несмотря на свои способности и непривычное поведение, ищет дружбу и понимание, а Цубаки становится тем человеком, который помогает ей поверить в себя. Эта история сочетает в себе элементы мистики, романтики и школьной драмы, что делает ее привлекательной для широкой аудитории.
